冷凍電鏡技術解析結構主要風險在:A.樣品很不穩(wěn)定,樣品寄送過來的時候,已經降解或者聚集,無法進行后續(xù)處理;B.樣品在冷凍制樣的過程中,可能會被凍碎,從而無法進行后續(xù)處理;C.樣品純度可能很好,但是均一度很差,從而難以獲得樣品的高分辨結構;D.我們關心的區(qū)域可能在整個復合體中有很強的柔性,從而經過二維或者三維平均后,我們關心區(qū)域的分辨率會比較差甚至看不見,達不到我們的預期;E.一些配體,比如藥物前體分子,分子量太小,不一定能在電鏡的密度圖中觀測到;F.對于合適的樣品,我們冷凍制樣需要優(yōu)化的參數(shù)有很多,包括樣品濃度的優(yōu)化,blottime的優(yōu)化,溫度的優(yōu)化,grid規(guī)格(銅網或者金網)的優(yōu)化等一系列條件的優(yōu)化。因此冷凍電鏡制樣需要豐富的經驗和充足的機時支持,不同的實驗者,成功率可能差別很大。冷凍電鏡技術的獨特優(yōu)勢:適合于研究結構不規(guī)則的大分子復合物,對于分子量的上限沒有限制。湖州原位冷凍電鏡技術服務公司
冷凍電鏡技術測定結構的幾種方法:X射線晶體學、NMR、和冷凍電鏡技術各有優(yōu)缺點,將這幾種方法結合共同研究結構與功能將使結構生物學家對所研究的分子有更為全部的理解,而這些信息是單用任何一個方法所無法獲得的。將X射線晶體模型與經電鏡獲得的密度圖重合可以對電鏡三維重構的結構作更詳盡的解釋,例如將牛的水通道(AQP1,與人的有90%同源性)的高分辨率的晶體結構與先前用冷凍電鏡技術重構出來的人的中等分辨率水通道的三維結構進行比較,可以進一步確定冷凍電鏡獲得的中等分辨率的結構,同時也顯示出了冷凍電鏡技術的優(yōu)勢和局限性。另一方面,較低分辨率的電鏡三維重構模型可以用來解釋病毒或大分子的晶體結構。而且,將X射線晶體的精細結構與冷凍電鏡的重構模型結合構建生物大分子復合物在發(fā)揮功生物學功能過程中出現(xiàn)的構像變化模型。這很大程度增加了我們對于復雜分子的活動機制的理解。電子顯微技術,成像技術,計算機技術,生物信息技術等不同學科的結合,將為我們提供研究生命現(xiàn)象與本質的強有力的手段。金華冷凍電鏡技術方案冷凍電鏡技術測定結構的幾種方法:X射線晶體學、NMR、和冷凍電鏡技術。
冷凍電子顯微鏡技術之樣品成像:低劑量輻照成像,普通的樣品材料在進行TEM表征時,電子劑量越高,成像質量越好。但生物樣品受到的輻照損傷卻是和累積的輻照總劑量相關的。更詳細一點說,隨著輻照劑量的增加,輻照損傷對高分辨細節(jié)的破壞更嚴重。因此,為了盡可能地獲得更多的細節(jié),就必須要對樣品采用用低劑量輻照成像。在冷凍電鏡技術中,常用的低劑量輻照成像法有兩種:冷凍電子斷層掃描法,單顆粒分析成像法。冷凍電鏡技術中的電子斷層掃描技術(cryogeniccomputedtomography):進行斷層掃描時,樣品被連續(xù)不停地旋轉,并在每個旋轉角度上都進行一次成像。每一幅電子顯微像是物體在不同投影方向的二維投影像,經傅立葉變換會得到一系列不同取向的截面,當截面足夠多時,會得到傅立葉空間的三維信息,再經傅立葉反變換便能得到物體的三維結構。
冷凍電子顯微鏡技術具有研究對象普遍、樣品需求量少、更接近生理狀態(tài)等獨特優(yōu)勢,隨著電子顯微鏡的硬件設備和結構解析的軟件算法等方面不斷取得的重要突破,冷凍電鏡技術必將在研究對象、分辨率水平和研究方法等各個方面取得重大進展。當然,冷凍電鏡技術也面臨著許多技術上的挑戰(zhàn),怎樣改進樣品的制備技術,如何如何客觀地對三維重構的結果進行檢驗、明確結構解析的分辨率以及對生物大分子構象不均一性的分析等仍然是冷凍電鏡研究中有待解決的重要問題。但是,挑戰(zhàn)越多,機遇也就越多。相信有關的研究者們,一定能夠冷靜抓住機遇,勇敢迎接挑戰(zhàn),讓冷凍電鏡技術在結構生物學、細胞生物學等領域發(fā)揮更大的作用,幫助我們更加深入、透徹地研究各種生命現(xiàn)象。冷凍電鏡技術主要應用在單個蛋白質分子結構的分析方面。
冷凍電鏡技術解析結構的一般流程是怎樣的?對樣品的要求是什么?冷凍電鏡解析蛋白結構一般流程為:蛋白表達純化;負染樣品準備:約2小時完成;負染樣品的數(shù)據(jù)收集:約8小時完成;冷凍樣品的準備:約4小時完成;冷凍樣品的數(shù)據(jù)收集:48-120小時完成。三維結構重建。冷凍電鏡解析蛋白結構對蛋白質的要求:分子量:一般需要樣品的分子量在200kD以上。緩沖液:緩沖液中不能含有多糖,DMSO,甘油等有機物質,這些會降低樣品的襯度,難以獲得高分辨的三維結構。一般而言,緩沖液為20mMHepes,150mMNaCl。濃度:一般而言,可溶性蛋白濃度應在1mg/ml左右,膜蛋白應保證濃度在5mg/ml左右。體積:20ul足夠(前提是需要蛋白濃度達標,做一個樣品3ul左右)。均一性:分子篩行為表現(xiàn)為單一的峰,均一性大于90%。冷凍電鏡技術之冷凍透射電鏡優(yōu)點:加速電壓高,電子能穿透厚樣品。廣州低溫電子顯微鏡技術方案
冷凍電鏡技術使生物分子成像,變得更加簡單,把生物化學帶入了一個新紀元。湖州原位冷凍電鏡技術服務公司
低溫冷凍透射電鏡技術的特點:相對于常溫透射電鏡,低溫透射電鏡的優(yōu)勢有:①快速冷凍制樣技術將樣品固定在玻璃態(tài)的冰層中,避免了水或溶劑結晶對樣品結構的破壞,能夠保持液相中有機分子自組裝體和化學反應中間體的微觀結構,避免了樣品干燥引起的結構變化;②高分子及化學反應體系常常具有非平衡態(tài)結構,快速冷凍制樣技術能夠保持住非平衡態(tài)結構,進而得以觀察;③低溫條件能夠盡可能保持有機和高分子等軟物質材料的微觀結構,明顯減少電子束對樣品的損傷。湖州原位冷凍電鏡技術服務公司
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